En cuanto a la calidad de la enseñanza universitaria, existen 5 universidades chilenas dentro del ranking de Shanghái, que contiene las 1.000 mejores universidades del mundo. La Universidad de Chile se encuentra entre las 500 mejores del mundo, seguida de la Universidad Católica que se encuentra entre las 600 mejores. Ya entre las 900 mejores se encuentra la Universidad Andrés Bello, Universidad Técnica Federico Santa María y la de Concepción, la única que no está en la capital. En la comparativa regional, la Universidad de Chile es la novena mejor de Latinoamérica.

En la actualidad existen numerosos convenios entre universidades españolas y chilenas, ya sean públicas y privadas, para la realización de intercambios universitarios, con un número creciente de estudiantes españoles universitarios que acuden en el marco de este tipo de programas.